Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smarcad1Q04692 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms