Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkczQ02956 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms