Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms