Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms