Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcqQ02111 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms