Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms