Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mc1rQ01727 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms