Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms