Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms