Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SeleQ00690 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SeleQ00690 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SeleQ00690 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SeleQ00690 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SeleQ00690 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SeleQ00690 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SeleQ00690 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeleQ00690 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeleQ00690 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SeleQ00690 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms