Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms