Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
F8a1Q00558 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms