Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcf7Q00417 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcf7Q00417 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms