Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou1f1Q00286 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms