Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms