Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cry1P97784 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cry1P97784 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cry1P97784 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cry1P97784 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cry1P97784 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cry1P97784 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cry1P97784 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cry1P97784 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cry1P97784 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms