Protein–RNA interactions for Protein: P97469

Snai2, Zinc finger protein SNAI2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai2P97469 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai2P97469 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai2P97469 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai2P97469 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai2P97469 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai2P97469 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai2P97469 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms