Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhodP97348 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhodP97348 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhodP97348 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RhodP97348 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhodP97348 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhodP97348 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhodP97348 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RhodP97348 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhodP97348 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhodP97348 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhodP97348 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhodP97348 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhodP97348 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhodP97348 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhodP97348 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhodP97348 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhodP97348 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhodP97348 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhodP97348 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhodP97348 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhodP97348 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhodP97348 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhodP97348 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhodP97348 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhodP97348 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhodP97348 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhodP97348 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhodP97348 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhodP97348 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhodP97348 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhodP97348 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhodP97348 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhodP97348 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhodP97348 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhodP97348 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhodP97348 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhodP97348 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhodP97348 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhodP97348 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RhodP97348 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RhodP97348 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RhodP97348 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhodP97348 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhodP97348 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RhodP97348 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhodP97348 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RhodP97348 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhodP97348 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RhodP97348 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhodP97348 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhodP97348 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhodP97348 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhodP97348 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhodP97348 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhodP97348 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhodP97348 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RhodP97348 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RhodP97348 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhodP97348 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhodP97348 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhodP97348 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhodP97348 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhodP97348 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhodP97348 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhodP97348 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhodP97348 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhodP97348 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RhodP97348 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RhodP97348 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhodP97348 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RhodP97348 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RhodP97348 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RhodP97348 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RhodP97348 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RhodP97348 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RhodP97348 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RhodP97348 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RhodP97348 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RhodP97348 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RhodP97348 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RhodP97348 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhodP97348 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhodP97348 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhodP97348 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhodP97348 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhodP97348 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhodP97348 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhodP97348 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhodP97348 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhodP97348 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RhodP97348 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhodP97348 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhodP97348 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhodP97348 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhodP97348 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhodP97348 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhodP97348 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhodP97348 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhodP97348 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms