Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms