Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgcdP82347 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgcdP82347 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgcdP82347 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgcdP82347 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgcdP82347 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgcdP82347 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SgcdP82347 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SgcdP82347 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SgcdP82347 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SgcdP82347 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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