Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx2P80206 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx2P80206 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx2P80206 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx2P80206 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx2P80206 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx2P80206 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx2P80206 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx2P80206 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx2P80206 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx2P80206 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms