Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp9xP70398 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp9xP70398 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp9xP70398 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp9xP70398 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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