Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms