Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms