Protein–RNA interactions for Protein: P70166

Cpeb1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpeb1P70166 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpeb1P70166 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpeb1P70166 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpeb1P70166 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpeb1P70166 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpeb1P70166 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpeb1P70166 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpeb1P70166 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpeb1P70166 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpeb1P70166 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpeb1P70166 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpeb1P70166 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpeb1P70166 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpeb1P70166 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms