Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms