Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms