Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms