Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SnnP61807 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnnP61807 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnnP61807 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnnP61807 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnnP61807 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnnP61807 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnnP61807 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnnP61807 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnnP61807 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnnP61807 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnnP61807 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnnP61807 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnnP61807 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnnP61807 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnnP61807 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnnP61807 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnnP61807 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnnP61807 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnnP61807 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SnnP61807 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnnP61807 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnnP61807 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnnP61807 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnnP61807 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnnP61807 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnnP61807 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnnP61807 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnnP61807 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnnP61807 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnnP61807 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnnP61807 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnnP61807 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnnP61807 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnnP61807 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnnP61807 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnnP61807 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnnP61807 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnnP61807 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnnP61807 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnnP61807 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SnnP61807 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnnP61807 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnnP61807 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SnnP61807 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SnnP61807 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SnnP61807 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SnnP61807 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SnnP61807 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SnnP61807 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnnP61807 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnnP61807 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnnP61807 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnnP61807 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnnP61807 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnnP61807 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnnP61807 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnnP61807 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnnP61807 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnnP61807 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnnP61807 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnnP61807 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnnP61807 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnnP61807 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnnP61807 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnnP61807 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnnP61807 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SnnP61807 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnnP61807 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnnP61807 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnnP61807 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnnP61807 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnnP61807 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnnP61807 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnnP61807 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnnP61807 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnnP61807 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnnP61807 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnnP61807 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnnP61807 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnnP61807 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnnP61807 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnnP61807 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnnP61807 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnnP61807 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SnnP61807 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnnP61807 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnnP61807 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnnP61807 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnnP61807 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnnP61807 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnnP61807 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnnP61807 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnnP61807 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SnnP61807 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnnP61807 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnnP61807 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnnP61807 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnnP61807 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnnP61807 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms