Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf13P61216 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf13P61216 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf13P61216 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf13P61216 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf13P61216 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf13P61216 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf13P61216 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf13P61216 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf13P61216 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf13P61216 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf13P61216 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf13P61216 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf13P61216 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf13P61216 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf13P61216 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf13P61216 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf13P61216 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf13P61216 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf13P61216 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf13P61216 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms