Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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