Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ActbP60710 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ActbP60710 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ActbP60710 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ActbP60710 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ActbP60710 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ActbP60710 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ActbP60710 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ActbP60710 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ActbP60710 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ActbP60710 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ActbP60710 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ActbP60710 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ActbP60710 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ActbP60710 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ActbP60710 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ActbP60710 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ActbP60710 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ActbP60710 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ActbP60710 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ActbP60710 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ActbP60710 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ActbP60710 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ActbP60710 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ActbP60710 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ActbP60710 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ActbP60710 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ActbP60710 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ActbP60710 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ActbP60710 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ActbP60710 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ActbP60710 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ActbP60710 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ActbP60710 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ActbP60710 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ActbP60710 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ActbP60710 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ActbP60710 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ActbP60710 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ActbP60710 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ActbP60710 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ActbP60710 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ActbP60710 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ActbP60710 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ActbP60710 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ActbP60710 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ActbP60710 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ActbP60710 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ActbP60710 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ActbP60710 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ActbP60710 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ActbP60710 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ActbP60710 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ActbP60710 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ActbP60710 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ActbP60710 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ActbP60710 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ActbP60710 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ActbP60710 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ActbP60710 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ActbP60710 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ActbP60710 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms