Protein–RNA interactions for Protein: P60603

Romo1, Reactive oxygen species modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Romo1P60603 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Romo1P60603 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms