Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps5P59438 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps5P59438 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps5P59438 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps5P59438 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps5P59438 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps5P59438 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps5P59438 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms