Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup43P59235 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup43P59235 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup43P59235 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup43P59235 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup43P59235 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup43P59235 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup43P59235 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup43P59235 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup43P59235 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup43P59235 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms