Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps33bP59016 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms