Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms