Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dpf3P58269 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms