Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NcstnP57716 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NcstnP57716 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NcstnP57716 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NcstnP57716 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NcstnP57716 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NcstnP57716 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NcstnP57716 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NcstnP57716 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NcstnP57716 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NcstnP57716 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NcstnP57716 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms