Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp25P57080 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp25P57080 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp25P57080 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp25P57080 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp25P57080 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp25P57080 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp25P57080 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp25P57080 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp25P57080 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp25P57080 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp25P57080 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp25P57080 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp25P57080 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms