Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lim2P56563 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lim2P56563 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lim2P56563 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lim2P56563 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lim2P56563 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lim2P56563 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lim2P56563 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lim2P56563 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lim2P56563 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lim2P56563 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lim2P56563 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lim2P56563 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lim2P56563 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lim2P56563 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms