Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1bbP56400 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms