Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp5P56399 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp5P56399 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp5P56399 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp5P56399 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp5P56399 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp5P56399 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp5P56399 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp5P56399 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms