Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Faf1P54731 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Faf1P54731 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Faf1P54731 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Faf1P54731 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Faf1P54731 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Faf1P54731 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Faf1P54731 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Faf1P54731 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Faf1P54731 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms