Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms