Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms