Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp1P52624 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp1P52624 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp1P52624 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp1P52624 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp1P52624 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp1P52624 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms