Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RorcP51450 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RorcP51450 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RorcP51450 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RorcP51450 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RorcP51450 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RorcP51450 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RorcP51450 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorcP51450 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorcP51450 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorcP51450 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorcP51450 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorcP51450 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorcP51450 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorcP51450 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RorcP51450 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RorcP51450 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorcP51450 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorcP51450 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorcP51450 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorcP51450 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorcP51450 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorcP51450 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorcP51450 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorcP51450 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorcP51450 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorcP51450 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorcP51450 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorcP51450 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorcP51450 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorcP51450 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorcP51450 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorcP51450 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorcP51450 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorcP51450 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RorcP51450 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorcP51450 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorcP51450 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorcP51450 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorcP51450 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorcP51450 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorcP51450 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorcP51450 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorcP51450 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorcP51450 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorcP51450 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RorcP51450 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorcP51450 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorcP51450 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorcP51450 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorcP51450 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorcP51450 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorcP51450 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorcP51450 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorcP51450 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorcP51450 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorcP51450 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorcP51450 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorcP51450 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorcP51450 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorcP51450 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorcP51450 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorcP51450 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorcP51450 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorcP51450 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorcP51450 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorcP51450 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorcP51450 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorcP51450 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorcP51450 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorcP51450 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorcP51450 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorcP51450 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorcP51450 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RorcP51450 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorcP51450 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorcP51450 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RorcP51450 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorcP51450 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorcP51450 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorcP51450 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorcP51450 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorcP51450 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorcP51450 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorcP51450 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorcP51450 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorcP51450 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorcP51450 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorcP51450 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorcP51450 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorcP51450 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorcP51450 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorcP51450 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorcP51450 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorcP51450 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorcP51450 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorcP51450 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorcP51450 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorcP51450 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorcP51450 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms