Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms