Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GdnfP48540 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GdnfP48540 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GdnfP48540 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GdnfP48540 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GdnfP48540 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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